野杏经济性状SSR关联分析及优异等位变异挖掘

摘要

【目的】为野杏优良性状基因挖掘、分子标记辅助育种及野杏资源的开发利用提供参考。【方法】以40个野杏无性系为研究对象,采用GLM模型,利用多态性较高的120对SSR引物对野杏20个重要经济性状进行关联分析,并通过无效等位基因对关联位点等位变异的表型效应进行分析,利用表型效应值找到最优无性系,获得典型载体材料。【结果】共获得64个与野杏经济性状显著关联的SSR位点(P<0.05),包括43个极显著相关联位点(P<0.01),64个位点的变异解释率为12.21%~77.48%,与产核量相关联的X44H位点的解释率最高。有40个位点分别与多个性状相关联,P1位点和X36位点分别与7个性状相关联,是关联性状最多的位点。除果形指数外,其余19个经济性状均受多个位点基因共同调控,表明这些性状可能存在连锁遗传,与核宽显著关联的位点最多,有18个。通过表型效应分析找出了406个有效等位变异,包含215个正向效应,190个负向效应,1个表型效应值为0。其中,122个有效等位变异同时对多个性状产生正向或负向效应,X19H-130的表型效应值最大,为4429.39,Y54-10的表型效应值最小,为-1501.23,二者均是与产果量相关联的等位变异。共挖掘出18个典型载体材料,其中210号、207号、164号、162号、211号、232号、241号、248号、198号分别携带了2个或2个以上优异等位变异。【结论】基于SSR的关联分析,筛选出与野杏重要经济性状相关联的优异等位变异及聚合优异等位变异的典型载体材料。