宏基因组测序技术在颌面部间隙感染细菌分布中的研究

摘要

目的 对比分析宏基因组测序(mNGS)与常规细菌培养在检测颌面部间隙感染致病微生物方面的差异与一致性,为临床早期明确颌面部间隙感染致病菌提供新的检测方法.方法 收集2020年3—6月就诊于郑州大学第一附属医院的16例口腔颌面部间隙感染患者的临床资料,分别使用mNGS及常规细菌培养方法对脓液进行检测,对两种方法的检验结果进行分析比较,包括检验周期、阳性检出率、厌氧菌、兼性厌氧菌及需氧菌检出率、病原菌分布、相对物种丰度、耐药基因.结果 mNGS平均检验周期为(18.81±3.73)h,细菌培养的平均检验周期为(83.25±11.64)h,前者短于后者(P<0.05).mNGS的阳性检出率100％(16/16),常规细菌培养的阳性检出率31.25％(5/16),前者高于后者(P<0.05).mNGS厌氧菌检出率为93.75％(15/16),细菌培养厌氧菌检出率为0(0/16),前者高于后者(P<0.05);mNGS的兼性厌氧菌检出率为75.00％(12/16),细菌培养的兼性厌氧菌检出率为25.00％(4/16),前者高于后者(P<0.05);mNGS的需氧菌检出率为25.00％(4/16),细菌培养的需氧菌检出率为12.50％(1/16),前者高于后者(P>0.05).在mNGS检测出的15种致病菌中,3种为革兰阳性菌,12种为革兰阴性菌;49种非致病菌中,16种为革兰阳性菌,32种为革兰阴性菌,1种为真菌.结论 与常规细菌培养相比,mNGS具有检验时间短、灵敏度高、准确率高的特点,为临床上早期明确颌面间隙感染致病菌提供新的检测方法,并有利于该疾病的早期临床诊断与治疗.