内源性与外源性加亚嘉西科逆转录病毒基因组序列分析

摘要

目的:确定内蒙古JSRV-NM病毒株在逆转录病毒与宿主共进化史上的地位.方法:从我国内蒙古羊种绵羊肺腺瘤病羊肺组织标本中分离出exJSRV-NM株.PCR方法扩增出exJSRV-NM和enJSRV-NM株全长cDNA并进行全基因组测序.应用DNAstar软件对JSRV-NM基因组上的U3、ENV、GAG/POL核苷酸序列进行分析.结果:克隆的exJSRV-NM株和enJSRV-NM株全基因全长分别为7 462 bp和7 430 bp.序列分析表明,exJSRV-NM株序列与Gen-Bank上收录的南非代表株基因组和JSRV21核苷酸全序相比其同源性分别为93.3%和99.2%.enJSRV-NM株序列与GenBank上收录的enJS56A1相比其同源性为94.8%.结论:我国内蒙古羊种所携带的JSRV-NM在逆转录病毒与宿主共进化史上属于古老型.