青海省部分地区马铃薯病毒种类与Y病毒株系类型研究

摘要

【目的】了解马铃薯主要病毒对青海省部分地区马铃薯生产的危害,明确青海省部分马铃薯产区主要病毒类型及PVY株系类别,对马铃薯病毒病的防治和品种选育工作提供科学依据。【方法】利用DAS-ELISA和RT-PCR结合生物信息学分析方法对采自青海省大通县和互助县的181份疑似马铃薯病毒病样品进行病毒种类检测和Y病毒株系类型分析。【结果】181份样品中,PVY、PVS、PVM和PLRV病毒的检出率分别为17.68%、19.34%、4.42%和4.42%,其中,PVY单独侵染率最高,达14.92%,其次PVS为12.71%,样品中未检出PVX、PVA和AMV病毒。复合侵染中以2种病毒复合侵染为主,其中PVS+PVM、PVY+PVS和PVS+PLRV发生情况较为常见。DAS-ELISA检测PVY单独侵染结合RT-PCR混检获得20份PVY阳性样品,对其进行马铃薯Y病毒株系血清学检测分析发现,青海省部分地区马铃薯Y病毒株系以PVY^(O+C)血清型为主,其中PVY^(O+C)血清型阳性株系19份,占比为95%,PVY^(N)与PVY^(C)血清型阳性株系各1份,均占比为5%。为进一步明确PVY亚株系,根据血清学检测结果,对获得的19个PVY分离物的基因序列进行分析,发现PVY病毒核苷酸一致率为97.0%~100%,氨基酸一致率为95.8%~100%,且未发现重组位点,种群基因较稳定,PVY分离物系统发育分析发现,16个PVY分离物与PVYN:O株系亲缘关系较近,3个PVY分离物PVYNTN-NW株系亲缘关系较近,青海省部分地区马铃薯Y病毒株系类型以PVYN:O、PVYNTN-NW株系为主,与血清学检测结果一致。【结论】青海省部分地区主要马铃薯病毒种类有PVY、PVS、PVM和PLRV,PVY和PVS是青海地区马铃薯病毒的主要流行种类,其中Y病毒株系类型以PVYN:O和PVYNTN-NW株系为主,且同源性很高,PVY的种群基因较稳定。