基于SSR标记贵州古茶树资源的遗传多样性分析及指纹图谱构建

摘要

为了贵州古茶树资源的有效保护和充分利用提供理论依据,采用EST-SSR标记对40份贵州古茶树资源进行了遗传多样性分析和分子指纹鉴定.结果表明:20个SSR标记在40份资源中共检测到76个等位基因,平均每个标记3.8个,PIC和Shannon信息指数平均值分别为0.462和0.936,多态性适中.76个等位基因在参试古茶树资源中的出现频率差异较大,变异范围为1.32％～89.74％.参试材料的Nei's遗传距离(D)为0.075 ～0.875,当D≈0.160时,40份古茶树资源可聚为6类,包括3个单独聚类和3个复合聚类.利用4个核心标记即可鉴定40份古茶树资源,并根据等位基因带型,获得18位数的分子指纹图谱号码,构建每份资源的分子指纹图谱.