m6A RNA甲基化调节因子与肝细胞癌预后的关系

摘要

目的 探讨N6-甲基腺嘌呤(m6A)RNA甲基化调节因子与肝细胞癌(HCC)预后的关系.方法 从美国国家癌症研究所基因组数据共享中心下载HCC样本和正常对照样本的RNA-seq转录组数据,并收集HCC样本临床病理资料.从RNA-seq转录组数据中获取FTO、YTHDC2、YTHDC1、ALKBH5、KIAA1429、METTL3、HNRNPC、YTHDF2、RBM15、YTHDF1、WTAP、METTL14、ZC3H13等十三种m6A RNA甲基化调节因子的表达数据,比较HCC样本和正常对照样本m6A RNA甲基化调节因子表达.采用单因素Cox回归分析和Lasso Cox回归分析筛选与HCC预后相关的m6A RNA甲基化调节因子,并构建风险模型,分析风险模型与HCC预后的关系.结果 HCC样本FTO、YTHDC2、YTHDC1、ALKBH5、KIAA1429、METTL3、HNRNPC、YTHDF2、RBM15、YTHDF1、WTAP表达均高于正常对照样本(P均<0.01),而两样本METTL14、ZC3H13表达比较差异均无统计学意义(P均>0.05).YTHDF1、ZC3H13、YTHDF2、METTL3和KIAA1429等五种m6A RNA甲基化调节因子是影响HCC预后的危险因素(P均<0.05).其中,ZC3H13高表达者预后良好,而YTHDF1、YTHDF2、METTL3、KIAA1429高表达者预后较差.根据YTHDF1、ZC3H13、YTHDF2、METTL3、KIAA1429等五种m6A RNA甲基化调节因子构建HCC预后风险模型,然后将HCC患者分为高风险者与低风险者,高风险者5年生存率明显低于低风险者(P<0.05);ROC曲线分析显示,该风险模型的曲线下面积为0.619.单因素和多因素Cox回归分析显示,风险模型评分是影响HCC预后的独立危险因素(P<0.01).结论 m6A RNA甲基化调节因子表达与HCC预后密切相关,有可能作为肿瘤诊断的分子标志物和潜在的治疗靶点.