延边黄牛和韩延牛血液外胞体中miRNA的差异表达分析

摘要

cqvip:为进一步探讨Exosome中miRNA对延边黄牛和韩延牛生长发育的分子调控差异。本研究从延边黄牛和韩延牛血液Exosome中分离出miRNA,通过RNASEQ测序和生物信息学技术分析了延边黄牛及韩延牛血液Exosome中miRNA的表达特点。结果表明,在延边黄牛和韩延牛血液Exosome中获得差异表达miRNA有524个,其中上调表达的271个,下调表达的253个,其中已知miRNA382个,新miRNA142个;差异表达miRNA的靶基因预测结果说明,在两个品种牛中共预测到52348个靶基因。GO富集分析可知,这些靶基因被富集到3473条生物学过程,394条细胞组分以及879条分子功能。KEGG分析可知,这些预测得到的miRNA的靶基因总共被注释到326条信号通路中,其中最显著富集的通路为mTOR信号传导通路。其中显著差异表达的miR-9-5p和miR-99b调控的一些靶基因都与mTOR信号通路有密切的关系。结论:血液Exosome中的miR-9-5p和miR-99b在延边黄牛和韩延牛生长发育差异的过程中可能发挥重要的作用。将为下一步在分子水平上探讨关键差异表miRNA影响边黄牛和韩延牛生长发育差异的分子机制提供试验基础。