基于水稻内含子长度多态性开发禾本科扩增共有序列遗传标记

摘要

通过在多态位点两侧的保守编码序列上设计引物,可以开发出在不同物种间通用的基于PCR的分子标记,称为扩增共有序列遗传标记(ACGM).[目的]探讨利用已公布的水稻籼、粳两亚种的基因组序列开发禾本科ACGM的可行性.[方法]根据水稻两亚种间的内含子长度多态性,开发了38对ACGM引物.用这些引物对玉米、粟、大麦、小麦、竹子、旱稗草和大米草6个属共12个不同材料进行PCR实验.[结果]几乎所有引物都可在至少1种材料中扩增出特异条带,而1/3以上的引物可以在全部供试材料中获得特异扩增产物.在每一种供试材料中,平均大约有2/3的引物可以成功扩增出目的条带.这些引物在各属内不同种、亚种或品种(系)之间的多态性比例在24.1%～90.3%之间,平均为44.6%.[结论]利用水稻基因组序列信息开发禾本科通用型ACGM是可行的.