水稻瘤矮病毒基因组第6片段(S6)序列测定与分析

摘要

[目的]了解水稻瘤矮病毒(RGDV)基因组结构与功能.[方法]根据已报道的RGDV基因组各片段末端序列及其反向重复特性,采用4轮RT-PCR的方法扩增RGDV基因组第6片段(S6),用生物学软件进行序列分析.[结果]得到了该病毒S6的全序列.S6全长1 651 bp,G+C含量39.13%,包含一个长的ORF,起始于第25位,终止于第1 497位,编码490个氨基酸,分子量为53.3 kD.[结论]该蛋白与伤瘤病毒(WTV)的P7的相似性为30.0%,与水稻矮缩病毒(RDV)的P7的相似性为31.7%.这是RGDV S6全序列的首次报道.