水稻基因组中抗病基因正选择方式及基因转换的研究

摘要

[目的]了解正选择压力和基因转换对水稻全基因组中NBS-LRR抗病基因家族进化的影响及二者之间的相互关系.[方法]对水稻全基因组中的NBS-LRR基因进行鉴别与分类,利用PAML和GENECONV程序分别进行正选择替代和基因转换分析.[结果]在19个组(包含89个NBS-LRR基因)中检测出了显著的正选择替换位点,且约有60%正选择位点位于LRR区域;56个基因至少参与了1次基因转换事件.同时,基因转换、正选择以及基因簇之间存在明显的相关性.在84%的参与基因转换的基因中都能检测出正选择位点,且至少有84%的发生基因转换或正选择的基因都位于基因簇中.[结论]水稻基因组中的NBS-LRR基因之间,存在着频繁的正选择替代和基因转换.