特殊竹林土壤细菌群落结构及多样性研究

摘要

细菌群落通常在根际土壤中表现活跃并占据主导地位,在土壤环境中具有极强的生态指示作用。为研究活竹酒酿造这种特殊竹林环境中土壤细菌群落结构及多样性,选择竹酒酿造区域的竹林核心区J1、非竹林区J2及竹林边缘区J3,在IonS5^(TM) XL测序平台上完成土壤细菌16S rDNA高通量测序。结果表明:样本细菌种类主要集中在酸杆菌门(Acidobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、芽单胞菌门(Gemmatinonadetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)。其中,竹林核心区J1土壤细菌以放线菌门OTUs数占比最高,但其优势菌群为酸杆菌门酸栖热菌属(Acidothermus);非竹林区J2以酸杆菌门占比最高,优势菌群为其下苔藓菌属(Bryobacter);竹林边缘区J3处于竹林生境和非竹林生境的交汇地带,生境不稳定,土壤细菌以变形菌门占比最高,优势菌属主要包括变形菌门鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、酸杆菌门苔藓菌属(Bryobacter)、芽单胞菌门金雀花属(Gemmatimonas)等,群落内物种较为复杂,但其细菌群落结构仍与竹林核心区J1相似。总体上,随着样本从非竹林区逐渐接近竹林核心区,细菌群落多样性总体呈现先增加后降低的趋势,可能与竹林单一生境有关;个别细菌菌群数量和群落结构发生了较大变化,活竹酒酿造环境使得竹林土壤放线菌门而非变形菌门数量最多,或与当地独特的竹酒酿造环境相关。