蛋白质序列及其翻译后修饰鉴定的盲搜索算法评价

摘要

蛋白质翻译后修饰鉴定是计算蛋白质科学的重要研究方向,研发速度快和精度高的鉴定算法及软件,是该方向的一个主要问题。本文回顾了蛋白质翻译后修饰鉴定的各类算法,并主要对蛋白质序列及其翻译后修饰鉴定的盲搜索算法和软件进行研究。通过对具有代表性的两个盲搜索软件InsPecT和SIMS,以及限定性搜索软件pFind的对比分析,对盲搜索算法在蛋白质序列及其翻译后修饰方面的瓶颈、问题及未来发展趋势做出了评价