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Shotgun方法在正常人泪液蛋白质组学分析中的应用

         

摘要

目的 探讨Shotgun方法用于分析泪液蛋白质组,完善正常人泪液蛋白质表达谱.方法 收集正常8人(8眼)泪液混合后用于分析,所有人泪液标本均根据自愿的原则,采用毛细管从每眼收集15μL泪液,用Shotgun方法检测泪液蛋白质:分别行溶液内酶解、反向高效液相色谱分离、电喷雾离子化质谱,所得数据搜索IPI人类蛋白库,并按照IPI号对蛋白进行GOA功能分类.结果 正常人泪液中共有352个蛋白质,高可信度蛋白质为73个,包括已知的高丰度蛋白质和泪液特异性蛋白质.参与生理过程和细胞过程的蛋白质占到泪液蛋白质总量的83.5%.鉴定出的蛋白质主要分布于细胞质中,已知最多的蛋白质为具有结合功能的泪液蛋白质.结论 Shotgun方法可有效分离和分析泪液蛋白质,该研究完善了成年人正常泪液蛋白质表达谱.

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