猫冠状病毒的临床流行特征及其遗传进化分析

摘要

为了解猫冠状病毒(FCoV)的流行情况,2018年-2020年收集来自广西、河南、广州和江西等地疑似猫传染性腹膜炎(FIP)病例108份.通过RT-nPCR方法对样品进行鉴定和部分S基因扩增和遗传进化分析.108份样品中阳性样品66份,阳性率61.1％,血清型分型均为Ⅰ型.将扩增所获得的57条S基因的分型序列与国内外其他参考毒株序列进行遗传进化分析,发现FCoV具有高度的遗传多样性,其中55个毒株与欧洲、日本和中国毒株都分别在不同分支,它们之间的核苷酸同源性为81.8％ ～93.7％.来自同一只猫的不同脏器毒株(FCoV GXBH-10)被划分在2个分支中,其中肺脏毒株与美国毒株OH11927亲缘关系较近,核苷酸同源性为93.8％,而其他脏器毒株却在另一个分支,暗示了共感染现象.对S蛋白3′末端19条氨基酸序列进行分析,发现突变位置主要发生在3个区域,分别为D1267 H1268→EY/EQ、H1444→N和T1454→N/S,是否这些突变可作为遗传标记,有待进一步验证.论文针对近年来FCoV的流行趋势进行了系统分析,为掌握FCoV流行规律及早期临床诊断提供参考.