2株H3N8亚型禽流感病毒HA和NA基因遗传变异分析

摘要

采用RT-PCR技术扩增了2株H3N8亚型流感毒株A/duck/Guangxi/69/2009和A/chicken/Guangxi/2117/2010的HA和NA基因,并与GenBank中收录的其他毒株序列进行比较分析和遗传进化分析.结果表明,分离株的HA与NA基因全长分别为1 733 bp、1 432 bp.A/duck/Guangxi/69/2009株的HA基因与A/duck/Siberia/100/01株的相似性最高,A/chicken/Guangxi/2117/2010株的HA基因与A/white munia/HongKong/4519/00株的相似性最高；而A/duck/Guangxi/69/2009株的NA基因与A/duck/Eastern China/91/09株的相似性最高,A/ chicken/ Guangxi/ 2117/2010株的NA基因与A/aquaticbird/Korea/KN-1/04株的相似性最高.2株H3N8禽流感病毒位于同一分支,同源关系较近.2株H3N8禽流感病毒的HA推导的氨基酸剪切位点序列均为P-E-K-Q-T-R,为典型低致病性禽流感病毒的特征序列.