青蛤(Cyclina sinensis)IKK基因的克隆及其在鳗弧菌(Vibrio anguillarum)刺激下的表达分析

摘要

利用构建的青蛤(Cyclina sinensis)转录组文库,筛选到青蛤IKK基因的类似序列.经设计引物克隆比对后确认为CsIKK基因.利用生物信息学软件在线对该基因进行结构分析.采用PCR技术克隆基因,并使用实时荧光定量PCR技术克隆得到CsIKK基因在青蛤五个不同组织中的表达情况及在鳗弧菌(Vibrio anguillarum)的刺激下IKK基因在青蛤血淋巴中的时序性表达情况.综合结果得到,CsIKK基因序列开放阅读框长2298bp,编码765个氨基酸.IKK基因在青蛤的血淋巴、外套膜、闭壳肌、肝脏、性腺和鳃六个组织中均表达,在血淋巴中表达量最高.青蛤IKK基因在鳗弧菌胁迫下表达量在6h时达到最大值,与对照组相比差异极显著(P＜0.01),表明该基因所指导的蛋白是青蛤重要的免疫信号通路蛋白.