青蛤(Cyclina sinensis) TRAF6基因克隆及其在Poly I∶C胁迫下的免疫应答

摘要

对青蛤(Cyclina sinensis)转录组文库筛选并克隆得到青蛤TRAF6(CsTRAF6)基因的cDNA序列,其开放阅读框为2337bp,编码778个氨基酸,分子量为86.59kDa.CsTRAF6蛋白包含RING型锌指结构,两个TRAF型锌指结构,coiled-coil结构域以及MATH结构域.经生物信息学及分子系统学分析表明CsTRAF6属于TRAF6家族的一员.利用实时荧光定量PCR方法检测了CsTRAF6基因在青蛤各个组织以及在Poly I∶C侵染下在血淋巴中的时序性表达情况.结果表明,CsTRAF6基因在青蛤血淋巴、闭壳肌、鳃、性腺、外套膜和肝脏中普遍表达,其中在血淋巴中的表达水平最高.在Poly I∶C刺激后的3h,青蛤血淋巴中CsTRAF6的表达量迅速升高,在6h达到最大值,说明青蛤的CsTRAF6基因参与了病毒类似物侵染下的免疫应答反应.