粗糙脉孢菌U3 snoRNA基因的鉴定及其表达和功能分析

摘要

通过对粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)小RNA的cDNA文库筛选及基因组分析,鉴定了3个U3 shoRNA基因,命名为NcU3A、NcU3B和NcU3C,这3个基因表达的U3 snoRNA的大小分别为262,270和275 nt.同时,Northern杂交还揭示出不同大小的U3 snoRNA剪切变体,表明U3 snoRNA的表达存在复杂的转录后加工.粗糙脉孢菌U3 snoRNA都具有物种间保守的与18S rRNA配对的功能区;NcU3A及其剪切变体还具有一段过去没有报道的与26S rRNA互补的反义序列,这段反义序列并不指导对应的rRNA位点的甲基化修饰,可能具有rRNA分子伴侣的作用.粗糙脉孢菌U3 snoRNA都是独立转录的基因,每个基因中均包含一个小内含子序列,其插入位点与酵母U3相似,表明它们古老的起源.研究结果对阐明U3 snoRNA的结构进化及功能多样性具有重要意义.