轻症和重症流感肺炎患者外周血单个核细胞环状RNA表达谱差异分析

摘要

目的 探索轻症和重症流感肺炎患者外周血单个核细胞(PBMC)环状RNA (circRNA)表达谱差异.方法 选取2018年12月至2019年3月北京朝阳医院感染和临床微生物科收治的轻症和重症流感肺炎住院患者各10例,采用ClariomTMD基因芯片检测两组患者PBMC中的circRNA表达谱,以差异倍数(FC)绝对值＞2且P＜0.05为标准筛选差异表达circRNA,进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组大百科全书数据库(KEGG)信号通路富集分析.结果 轻症患者年龄[M(P25,P75)]为62.0(34.5,69.8)岁,其中男性4例;重症患者年龄[M(P25,P75)]为50.0(37.0,60.0)岁,均为男性.共筛选出轻、重症患者PBMC差异表达circRNA 137个,其在轻症患者中表达上调和下调的个数分别为101和36个,其中上调表达最显著的是hsa circ_0091073(FC=160.898,P＜0.05),下调表达最显著的是hsa_circ 0092219(FC=-17.630,P＜0.05).GO富集分析显示,与差异表达circRNA相关的GO二级条目共111个(P＜0.05);与上调表达circRNA相关的包括DNA转录模板、DNA转录模板调控、RNA聚合酶Ⅱ转录调节等;与下调表达circRNA相关的包括中细粒细胞脱颗粒、杀死其他生物的细胞和防御真菌等.KEGG信号通路分析显示,与差异表达circRNA相关的代谢通路共37条(P＜0.05);与上调表达circRNA相关信号通路包括核转录因子-κB(NF-κB)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等;与下调表达circRNA相关的信号通路包括癌症的转录失调、叶酸碳库和其他类型O-聚糖生物合成等.结论 轻症与重症流感肺炎患者PBMC中circRNA表达存在明显差异,可能通过多个信号通路在流感肺炎致病机制中发挥作用.