粉棒束孢几丁质酶基因cDNA全序列克隆及结构特征分析

摘要

通过设计基因保守区的特异性简并引物,运用SMART RACE RT-PCR技术,首次从粉棒束孢中克隆出完整的几丁质酶基因.该基因cDNA全长1549bp,5'端非翻译区89bp,3'端非翻译区有188bp,开放阅读框 (ORF) 1272bp, 编码423个氨基酸.信号肽长度为22个氨基酸.信号肽很可能需要两次剪切.成熟的蛋白理论分子量为43.9kDa,理论等电点为5.67.氨基酸序列具有几丁质酶18族的两个高度保守的活性区域,一个是酶作用活性位点,另一个是几丁质结合区域.该蛋白可归于几丁质酶18族V类.成熟蛋白的氨基酸序列与裂虫壳AAV98691、白色扁丝霉CAA45468、菌生轮枝孢AAP45631、莱氏野村菌AAP04616和球孢白僵菌AAN41261的同源性分别为91%,89%,80%,76%和75%.