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COI基因作为丛赤壳科真菌DNA条形码的测试

         

摘要

以丛赤壳科33种76个菌株为材料,探讨COI基因作为该科DNA条形码的可能性.结果表明,该DNA片段存在较多内含子,为了获取某些种的短片段,需设计许多引物,PCR扩增与测序成功率低,难以达到便捷、快速的物种鉴定的目的.因此,COI不宜作为丛赤壳科的DNA条形码.对已获得的少数片段进行分析表明,该基因对丛赤壳科部分种具有较强的物种鉴别力.%COI gene was tested with 76 strains of 33 species of the nectriaceous fungi to investigate its feasibility of serving as a DNA barcode. The results indicated that introns are present in some species, which made it difficult for PCR amplification and sequencing. COI gene is not a good DNA barcode for this group. Analysis of the obtained COI sequences showed that this gene may have the capacity to distinguish species of the nectriaceous fungi.

著录项

  • 来源
    《菌物学报》 |2012年第2期|243-250|共8页
  • 作者

    赵鹏; 罗晶; 庄文颖;

  • 作者单位

    中国科学院微生物研究所 真菌学国家重点实验室 北京100101;

    鲁东大学菌物科学与技术研究院山东省食用菌技术重点实验室 山东烟台264025;

    中国科学院微生物研究所 真菌学国家重点实验室 北京100101;

    中国科学院微生物研究所 真菌学国家重点实验室 北京100101;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类
  • 关键词

    种内与种间差异; PCR扩增与测序成功率; 邻接树;

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