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捕食线虫真菌少孢节丛孢Arthrobotrys oligospora线粒体基因组的异质性

         

摘要

捕食线虫真菌少孢节丛孢Arthrobotrys oligospora是子囊菌中的一个食肉性丝状真菌,其菌丝体可变态为各种结构精巧的捕食器官用于捕食线虫,在生物防治和进化上极具研究潜力。线粒体基因细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ基因(COX1)在真菌物种鉴定中的效果饱受争议。本研究对A.oligospora的不同单孢培养的菌株进行了COX1基因的扩增和比较研究,力求探究各代菌株的异质性变化程度和范围,了解其产生的原因。结果表明,SNPs在不同单孢代系和家系之间、同一代系和家系内部均稳定存在,但代系间的遗传变异大于家系间的遗传变异,各代系未呈现独特的遗传结构。随着代数的增加,核酸多态性的变化与F1代趋于一致,大部分独特的等位基因型出现在F3代,说明该种COX1基因可能还有大量潜在的新基因型有待发现。重组分析显示,多个SNP位点间发生了频繁的重组事件,说明线粒体异质性在群体内稳定存在,进一步分析发现基因重组和COX1基因多拷贝可能是造成异质性的原因。本研究为进一步揭示COX1基因在捕食线虫丝孢菌进化上的作用,以及评估线粒体基因在该类真菌分子鉴定中的效果提供了科学依据。

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