基于网络药理学和分子对接技术探讨经典名方泻白散治疗肺炎的潜在作用机制

摘要

目的 采用网络药理学方法和分子对接技术探讨经典名方泻白散治疗肺炎潜在作用机制.方法 通过检索TCMSP、BATMAN-TCM数据库获取泻白散活性成分及作用靶点,通过DisGeNET、Gene Cards数据库获取肺炎的相关靶点,筛选得到泻白散治疗肺炎的活性成分及作用靶点,采用Cytoscape 3.6.0构建药物-成分-靶点-疾病作用网络.利用STRING数据库和Cytoscape 3.6.0软件构建泻白散治疗肺炎靶点间蛋白质-蛋白质互作关系(PPI)网络并筛选得到关键靶点及其PPI网络.利用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析.最后利用AutoDock工具对泻白散成分和靶点进行分子对接.结果 本研究通过构建药物-靶点-疾病网络,发现泻白散中74个活性成分可以作用于与肺炎相关的53个靶点,其中槲皮素、血根碱、山柰酚、β-谷甾醇等成分是潜在药效成分.利用拓扑学筛选得到关键靶点9个,包括白细胞介素8(IL8)、白细胞介素6(IL6)、白细胞介素1β(IL1B)、肿瘤坏死因子(TNF)等;GO分析获得90个条目,泻白散治疗肺炎可能涉及炎症反应、免疫应答、细胞因子活性等过程,KEGG分析获得41个条目,炎症性肠病、百日咳等通路可能是泻白散治疗肺炎的潜在通路,分子对接结果显示方中主要活性成分槲皮素、血根碱、山奈酚、β-谷甾醇等与核心靶点IL8,IL6,IL4和TNF等均能实现自发结合.结论 中医经典名方泻白散中槲皮素、血根碱、山奈酚等活性成分可能通过炎症性肠病、百日咳等通路实现对肺炎的防治.