一例PPRV阳性羊鼻拭子样本N、P、M、F、H基因的序列测定和遗传进化分析

摘要

为对采集自昆明某大型牲畜交易市场的一例PPRV阳性鼻拭子样本进行追根溯源,设计引物采用RT-PCR方法进行PPRV病毒基因组关键基因N、P、M、F、H核苷酸序列扩增,并进行序列测定和遗传进化分析.结果显示:N、P、M、F、H基因均有预期片段扩增,其读码框(ORF)长度分别为1578、1531、1008、1641及1830 nt;N、P、M、F及H构建的遗传进化树均显示所测毒株为基因IV型,同2013年在新疆伊犁山羊中检测到的毒株(KM091959)同源性最高,N、P、M、F、H核苷酸同源性分别为99.2％、99.0％、99.4％、99.6％和99.3％,推断氨基酸同源性分别为98.7％、98.4％、100.0％、99.8％和99.3％.研究表明,检测到的毒株仍为2013～2014年我国PPRV流行期的基因IV型毒株,变异较小;所测毒株的N、P、M、F、H 5个关键基因中,M基因最保守、其次是F/H基因,而N、P基因略有变异.