底播虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)肠道可培养细菌动态分析

摘要

本研究旨在研究底播虾夷扇贝肠道微生物多样性及其动态变化,并分离潜在益生菌应用于虾夷扇贝幼体培育。实验用底播虾夷扇贝于2014年12月份底播,分别于2015年1月、4月和7月进行样品采集。以2216E培养基对肠道细菌进行分离、纯化,提取DNA并通过16S rDNA测序对分离的细菌进行鉴定。结果表明所有可培养细菌属于变形菌门、厚壁菌门和放线菌门,其中变形菌门占比78.9%,占绝对优势。属水平上,肠道分离可培养细菌隶属于弧菌属Vibrio,Aliivibrio,希瓦氏菌属Shewanella,科迪单胞菌Kordiimonas,假交替单胞菌属Pseudoalteromonas,假单胞菌属Pseudomonas,气单胞菌属Aeromonas,海洋居住菌属Pelagicola,黑杆菌属Phaeobacter,沈氏菌属Shimia,噬琼胶菌属Agarivorans,噬冷杆菌属Psychrobacter,海单胞菌属Marinomonas,克鲁维菌属Kluyvera,芽孢杆菌属Bacillus,漫游球菌属Vagococcus,香味菌属Myroides,黄杆菌属Tenacibaculum和微球菌属Micrococcus。从多样性指数分析看,1月(4.24)和4月(4.28)的Shannon多样性指数高于7月(3.96)。1月、4月和7月的Pielou指数分别为0.97、0.97和0.95,说明三个采样日的物种分布较为均匀。Bray-Curtis和Sørensen相似性指数显示,7月份肠道微生物菌群与1月和4月份相似性较低(分别为0.27和0.23),随着底播时间和季节转化,底播虾夷扇贝肠道微生物变化较大,尤其夏季(7月份)与春季(4月份)和冬季(1月份)差异较大。