miRNA-mRNA双重表达谱在前列腺癌分子调控机制中的作用

摘要

目的对前列腺癌的mRNA和miRNA的双重表达谱进行生物信息学分析,探讨前列腺癌的分子调控机制并识别与前列腺癌相关的生物标记。方法从GEO数据库中获取前列腺癌的mRNA和miRNA双重表达谱数据,首先采用差异表达分析提取与前列腺癌相关的上调和下调的miRNA和mRNA,然后通过Pearson相关分析确定最显著上调的和下调的miRNA与其靶向基因的反向调控关系,通过广义典型相关分析(GCCA)探讨miRNA和mRNA的分子调控机制并构建调控网络,识别与前列腺癌相关的生物标记。结果共发现117个差异表达的miRNA和9054个差异表达的mRNA,其中有15个miRNA和35个mRNA表达下调,20个miRNA和36个mRNA表达上调;Pearson相关性分析显示,miR-137反向调控HOXC4、NPIPL3和WSB1,miR-367反向调控MEFA及TNFAIP6;GCCA分析显示,MED13L的第一主成分权系数在前列腺癌患者中最高,第一主成分权系数较高的TRRAP被证实与前列腺癌高度;miR-29b、miR-488*与前列腺癌高度关联且在miRNA-mRNA的分子调控网络中调控的基因数最多。结论miR-29b和miR-29b-1*在前列腺癌相关的分子调控机制中有着重要的作用,可以作为潜在的阻止前列腺癌发生和发展的治疗靶向。