基于内源性竞争性网络的Ⅰ型、Ⅱ型子宫内膜癌关键长非编码RNA和微小RNA分析

摘要

目的 基于内源性竞争性网络分析可用于子宫内膜癌(EC)分型及诊治的潜在生物标志物.方法 从TCGA数据库中总结EC差异表达的基因,筛选出32个基因来构建内源性竞争性网络.采用基因本体论(GO)和京都基因与基因组数据库(KEGG)富集分析、相关性分析、生存分析及GEO数据集验证,进一步筛选关键基因.结果 Ⅰ型EC和Ⅱ型EC之间存在59个差异表达的长非编码RNA(lncRNA)、51个差异表达的微小RNA(miRNA)和843个差异表达的mRNA.在此基础上,建立了内源性竞争性网络,进一步筛选出与EC分型及预后相关的关键基因.在TCGA数据库中,LINC00667、miR-34c、miR-449a、miR-449b和TMCC3均与EC患者生存率相关,LINC00667和TMCC3表达越高,患者生存率越低,而miR-34c、miR-449a、miR-449b表达越高,患者生存率越高.Pearson相关分析结果显示,LINC00667与TMCC3呈正相关(P0.05).TMCC3高表达与EC的病理分型、年龄和分化程度有关(P0.05).miR-34c、miR-449a、miR-449b低表达与EC的病理分型、分化程度和FIGO分期有关(P0.05).结论 LINC00667-miR-34c/miR-449a/miR-449b-TMCC3是Ⅰ型和Ⅱ型EC内源性竞争性网络中的关键基因,且均具有良好的预后评估价值.