基于序列分析的13个中国梨品种S基因型鉴定(英文)

摘要

为鉴定中国梨S-RNase基因及其S基因型,根据日本梨S-RNase基因保守区设计引物,对13个中国梨品种进行基因组PCR特异扩增,并对PCR产物克隆、测序、序列分析.结果鉴定出13个S等位基因,其中11个S基因与GenBank中已知的S1,S7,S12,S15,S16,S18,S19,S22,S27,S29,S34-RNases相同,另外2个则为新的S-RNase基因,命名为S37-RNase和S38-RNase,GenBank接受号分别为DQ839238、DQ839239.13个S等位基因中,在推导氨基酸水平上,S18与S27相似性最低,为58%,S7与S27,S12与S19,S15与S37及S15与S38间相似性最高,为94%.经分析,S19为中国梨中出现频率最高的等位基因,对其DNA序列进行限制性酶切位点分析,建立了一种快速、经济鉴定S19的方法,该方法无需测序而仅使用特异的限制性内切酶AflⅡ对PCR产物进行酶切消化.根据分子鉴定结果,13个中国梨品种S基因型被确定为:冰糖(S16S19),六棱(S16S19),锦香(S34S37),鹅酥(S15S38),蜜梨(S19S29),甜橙子(S7S12),大青皮(S19S34),秋白(S19S34),紫酥(S19S34),花长把(S19S22),灌阳雪梨(S18S27),早蜜(S19S29),青面(S1S18).