利用高通量测序技术分析猪抗体库的组成特征

摘要

宿主适应性免疫系统通过产生种类多样的抗体保护其免受病原侵害,而传统的低通量测序方法无法完成对宿主抗体库的测序.本研究通过多重聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)从猪外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中扩增获得猪B细胞受体(B cell receptor,BCR)重链文库,经二代测序建立并分析健康猪抗体库的组成特征.结果表明:3周龄仔猪在正常情况下对抗体库IGHV、IGHD、IGHJ基因使用具有偏好性,其中IGHV1-4和IGHV1S2是使用最频繁的2种V(variable)基因,有8种IGHV基因的使用频率之和超过80％,另外发现重链互补决定区3(heavy chain complementarity determining region 3,HCDR3)的长度呈正态分布,平均长度约为15.8个氨基酸.本研究成功建立了适用于猪抗体库的高通量测序方法,可为未来进一步深入理解不同状态(生理、病理)猪抗体库的特异性组成提供有效的研究方法.