ox-LDL刺激的巨噬细胞中circRNAs差异表达及功能预测

摘要

目的:探究环状RNAs(circRNAs)在氧化型低密度脂蛋白(ox-LDL)刺激的巨噬细胞中的差异表达情况及功能预测.方法:采用人单核细胞系THP-1,用佛波醇12-十四酸酯13-乙酸酯(PMA)预处理细胞48 h,随后给予ox-LDL 50μg/mL刺激单核源巨噬细胞24 h构建巨噬细胞炎症模型.利用microarray芯片筛选出差异表达的circRNAs.通过qRT-PCR实验检测芯片中差异表达的circRNAs.利用CircInteractome、TargetScan和miRecords数据库预测circRNA_0007478潜在的靶基因.结果:芯片筛选结果提示在ox-LDL刺激的巨噬细胞中有5条circRNAs表达显著上调,2条circRNAs表达显著下调.qRT-PCR证实其中4条表达显著上调,2条表达显著下调.生物信息学分析推测,circRNA_0007478可通过结合miRNA-765进而影响下游蛋白的表达,发挥潜在的调控作用.结论:在ox-LDL刺激的巨噬细胞中存在circRNAs的差异性表达,circRNA_0007478可能通过结合miRNA-765调控下游基因参与动脉粥样硬化进程.