一种处理混合患病兄弟对IBD数据连锁分析的方法

摘要

患病兄弟对(affected sib-pair,ASP)设计是连锁分析中的重要方法,得到了广泛的研究和应用.然而,实际问题中患病兄弟对中常常会混杂部分半兄弟对,而且由于个人隐私等原因,兄弟对关系的信息往往缺失,我们称这种数据为混合患病兄弟对(mixed affected sib-pair,MASP).对混合患病兄弟对的IBD(identical by descent)数据给出了一种进行连锁分析的方法,构造了可识别的统计模型,证明了用于进行连锁分析的似然比检验统计量的渐近零分布服从自由度为3的卡方分布,同时给出了求解参数估计的EM算法.统计模拟表明,该方法在小样本情形下具有良好表现.