Illumina测序16S rRNA标签法分析细菌性阴道病患者阴道菌群多样性

摘要

目的 从菌群总体角度分析和比较健康育龄期女性和细菌性阴道病(BV)患者阴道菌群差异.方法 采集临床Amsel标准及Nugent评分筛选的37例BV患者及37例健康育龄期女性阴道穹窿分泌物标本,提取总基因组DNA,对16S rRNA V6区基因进行扩增,所有扩增的PCR产物经Illumina测序后,通过BIPES、UCHIME、TSC、GAST最终得到样品的物种信息.结果 健康育龄期女性阴道分泌物乳酸杆菌占95％以上,单独以惰性乳酸杆菌或卷曲乳酸杆菌为主,或者两者比例相当,同时存在少量加德纳氏菌属,颗粒链球菌属,链球菌属,普氏菌菌属,埃希氏杆菌属和其它菌属；30例BV患者阴道菌群Alpha多样性明显增加(P＜0.001),Beta多样性也发生了明显变化,表现为乳酸杆菌明显减少,其相对比例从45％到1％(24例),以惰性乳酸杆菌为主,部分患者(6例)甚至未检出,同时加德纳氏菌属,普氏菌菌属,颗粒链球菌属,厌氧球菌,微单胞菌属,Peptoniphilus.harei,消化链球菌属,戴阿李斯特杆菌属等相对丰富度增加,不同于既往研究的是7例BV患者以少见的格氏乳杆菌,嗜酸乳杆菌为优势菌群,约占75％～50％.结论 健康育龄女性阴道菌群以乳酸杆菌占绝对优势,单独以惰性乳酸杆菌或卷曲乳酸杆菌为主,或者两者相当,并与多种微生物并存；大部分BV患者阴道菌群表现为乳酸杆菌显著减少甚至缺失,小部分BV患者以少见的格氏乳酸杆菌、嗜酸乳酸杆菌为优势菌群.