广西巴马小型猪PPARγ基因克隆及组织表达差异分析

摘要

【目的】克隆广西巴马小型猪过氧化物酶增殖物激活受体γ基因（PPARγ），并确定其在不同组织中的表达情况，为后续研究该基因在猪支原体肺炎（MPS）中的作用机制打下基础。【方法】利用RT-PCR克隆广西巴马小型猪PPARγ基因，并进行BLAST比对分析及其推导蛋白的生物信息学分析；以实时荧光定量PCR检测PPARγ基因在18月龄广西巴马小型猪心脏、脾脏、肺脏、肾脏、大肠、小肠、肌肉和脂肪中的表达情况。【结果】广西巴马小型猪PPARγ基因开放阅读框序列1515bp，编码504个氨基酸。广西巴马小型猪PPARγ基因推导氨基酸序列与GenBank已发表的猪PPARγ基因（FJ436399.1）推导氨基酸序列同源性最高，达100.0%；而与牛（NM_181024.2）、人类（NM_005037.5）、猕猴（NM_001032860.1）、鼠（NM_001308354.1）和鸿雁（KJ019822.1）的同源性分别为92.9%、91.8%、91.5%、90.5%和83.5%，表明PPARγ基因高度保守。PPARγ蛋白分子量为57380.91Da，理论等电点（pI）为6.88，不稳定系数49.26，脂肪指数为88.21，亲水性平均水平为-0.293，为亲水性蛋白，其二级结构主要是α-螺旋，占总数的39.09%。PPARγ基因在广西巴马小型猪大肠组织中的表达量最高，极显著高于其他组织（P<0.01），而在肾脏、心脏和肌肉组织中的表达量极低。【结论】PPARγ基因在18月龄广西巴马小型猪的各组织中均有表达，但不同组织中的表达水平存在明显差异，可能与其在不同组织中的功能差异有关。