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耐辐射奇球菌未知功能基因DR_2566的克隆与生物信息学分析

         

摘要

克隆与辐射抗性相关但功能未知的新基因DR_2566,并应用生物信息学初步探讨其功能.应用PCR技术从耐辐射奇球菌基因组中扩增DR_2566基因全长ORF,选用pGEM-T载体进行TA克隆,通过限制性酶切及测序进行鉴定.应用生物信息学初步分析其染色体定位、蛋白序列、结构域及功能.成功克隆了耐辐射球菌未知功能基因DR_2566,生物信息学分析显示此基因全长为507 bp,编码168个氨基酸,其编码蛋白的理论分子量为19.136KDa,三级结构预测显示DR_2566蛋白质具有短修复内切酶性质.成功克隆了耐辐射奇球菌基因DR_2566全长ORF,生物信息学预测DR_2566蛋白可能具有错配修复作用.

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