基于网络药理学及分子对接虚拟筛选疏风解毒胶囊治疗新冠病毒肺炎(COVID-19)活性成分研究

摘要

目的筛选疏风解毒胶囊(SJC)治疗COVID-19的潜在活性成分。方法借助TCMSP、TCMID数据库检索SJC中活性成分及靶点,在GeneCards、OMIM数据库中收集COVID-19相关靶点,通过Cytoscape 3.8.0软件和STRING数据库建立“药材-活性成分-靶点”网络,绘制靶标蛋白互作(PPI)网络,使用R语言对核心靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析,运用Cytoscape 3.8.0软件建立“成分-靶点-共有通路”网络,预测其作用机制,将活性成分作为配体与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶、刺突糖蛋白(S蛋白)及受体血管紧张素转换酶Ⅱ(ACE2)进行分子对接。结果“药材-活性成分-靶点”网络包含8种药材,179个化合物和143个靶点,PPI网络得到疏风解毒胶囊治疗COVID-19的49个关键靶标蛋白;GO功能富集分析取得1330个条目(P<0.05),KEGG通路富集筛选得到142条信号通路(P<0.05),其中涉及人类巨细胞病毒感染,卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染,白介素-17(IL-17)信号通路,肿瘤坏死因子(TNF)信号通路,辅助性T细胞17(Th17细胞)细胞分化和缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路等。荷包牡丹碱、新黄烷酮和青黛酮符合Lipinski类药五规则且结合能远小于目前所报道具有抗SARS-CoV-2的临床用药。结论SJC“多成分-多靶点-多通路”协同作用,影响与SARS-CoV-23CL水解酶、S蛋白和ACE2的结合,实现对COVID-19的治疗作用。