高粱钾离子通道Shaker蛋白家族的鉴定及生物信息学分析

摘要

Shaker蛋白家族是植物体摄入钾元素的重要通道,其对植物环境耐受性发挥着重要的作用.本研究在高粱全基因组中鉴定了Shaker蛋白家族成员,并对其进行生物信息学分析.结果 表明,高粱中共鉴定到9个Shaker家族成员,共可分为5个亚族,且处于同一个亚族的基因结构以及蛋白质结构相似;亚细胞定位显示,这些成员均定位于细胞质膜上;共线性分析结果表明,高粱Shaker蛋白家族在禾本科的进化历程中相对保守;组织特异性及模拟干旱表达结果显示,Shaker成员具有明显的组织特异性与干旱应答差异.本研究有望为进一步研究高粱Shaker蛋白家族的生物学功能提供理论基础.