H5N1亚型禽流感病毒核蛋白基因的克隆及分子进化分析

摘要

用RT-PCR法,以1株H5N1亚型禽流感病毒RNA为模板,扩增了NP全基因cDNA.将NP cDNA克隆于pMD8-T载体,并对其进行测序.测序结果表明:所克隆的NP基因全长1542 bp,该核苷酸的片段包含了核蛋白完整阅读框架,其中编码区为1497个核苷酸,编码498个氨基酸.将其序列与6株A型流感病毒NP基因序列进行比较,各毒株之间NP基因核苷酸序列同源性为92.5%～95.9%,编码的氨基酸同源性为97.0%～98.4%.通过分子进化分析揭示了各毒株间的亲源关系.