大米草Na+/H+泵基因3'cDNA末端的克隆和序列分析

摘要

根据大米草Na+ /H+泵基因已克隆的一段基因组DNA序列的保守区设计引物,利用RACE技术,从大米草中分离并克隆出Na+ /H+泵基因的一段cDNA片段,长度为793 bp.该cDNA片段编码区推导出的氨基酸序列在NCBI网站上BLAST,结果显示该氨基酸序列与多种植物的Na+ /H+泵的C端氨基酸序列相似.该结果可以推断所克隆的cDNA片段为大米草Na+ /H+泵基因的3'端.将该cDNA对应的氨基酸序列与以前克隆的大米草Na+ /H+泵基因的一段DNA所对应的氨基酸序列拼接,然后与多种植物的Na+ /H+泵进行对位排列.结果显示,该氨基酸序列与芦苇、水稻、小麦、大麦、玉米、拟南芥和滨藜等植物的Na+ /H+泵基因对应的氨基酸序列有较高的相似性,其中与禾本科植物的相似性程度更高.