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魁蚶核糖体DNA基因转录间隔区的序列特征

     

摘要

以相应引物PCR扩增魁蚶(Scapharca broughtonii)的核糖体转录间隔子ITS-1和ITS-2片段,测序后得到长度分别为461 bp和533 bp的核苷酸序列(含引物).其中A、T、G、C 4种碱基的含量分别为21.91%、24.73%、28.20%和25.16%(ITS-1),27.02%、25.52%、25.52%和21.95%(ITS-2).将这2个片段与其他双壳贝类的相应片段进行比较,发现ITS-1和ITS-2引物在贝类中具有良好的通用性.比较几种贝类的ITS-1片段发现有1~100 bp长度不等、弥散状态的插入/缺失;对5种蚶科贝类的ITS-2相应片段进行比较,发现中间有75 bp 的保守区域,与本研究在魁蚶ITS-2群体序列研究中观察到的情况相同.

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