基于网络药理学及系统生物信息学探讨治疗重症哮喘的潜在机制

摘要

目的 基于网络药理学及系统生物信息学探讨治疗重症哮喘的潜在机制.方法 利用NCBI GENE数据库查找重症哮喘相关的靶点,将重症哮喘-靶点导入STRING11.0在线数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用,分析并筛选出核心模块与核心靶点,利用UniProt获取核心靶点的详细信息,并使用DAVID v6.8数据库对重症哮喘-靶点行基因本体分析和京都基因与基因组百科全书分析,使用柱状图与气泡图对GO和KEGG结果进行可视化.结果 得出80个与重症哮喘相关的靶点,在STRING11.0数据库获取蛋白相互作用关系的网络图共涉及74个节点,并获得核心基因14个,核心模块一个,核心基因包括肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-8(IL-8)、白细胞介素-4(IL-4)、白细胞介素-13(IL-13)、γ-干扰素(IFNG)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、白细胞介素-17A(IL-17A)、C反应蛋白(CRP)、酪氨酸蛋白激酶2(JAK2)、叉头框蛋白P3(FOXP3)、瘦素(LEP)、核因子-κB1(NF-κB1)、白细胞介素-33(IL-33).GO分析提示与重症哮喘相关的靶点主要富集在炎症反应、免疫反应、调节γ干扰素、调节蛋白激酶B信号转导等生物过程.KEGG分析得出14条信号通路,包括Jak-STAT信号通路、MAPK信号通路、Toll样受体信号通路、TGF-β信号通路、NF-κB信号通路、T细胞受体信号通路、RIG-I样受体信号通路、HIF-1信号通路等.结论 TNF、IL-8、IL-10、IL-4、IL-13等是治疗重症哮喘的潜在核心靶点,通过调节Jak-STAT信号通路、MAPK信号通路、Toll样受体信号通路等具有治疗重症哮喘的潜在作用.