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Dof转录因子的全基因组分析揭示辣椒发育和响应生物胁迫的功能特征

     

摘要

Dofs(DNA-binding with one zinc finger proteins)是植物特有的转录因子家族.Dof蛋白参与许多生物过程,如植物激素的产生,种子发育和环境适应.Dof蛋白已经在多种植物中被鉴定,但在辣椒中尚未开展类似的研究.我们在辣椒中鉴定出了33个可能的Dof基因(CaDofs).为了了解CaDof基因的特征,我们分析了其系统进化关系、蛋白质基序和进化历史.我们将含有25个基序且分布在8条染色体上的33个CaDof基因分成4个族.我们发现CaDof基因的扩张可追溯到最近的复制事件.茄科种系形成之前,片段复制在CaDof家族基因中占主导地位.通过RNA-seq分析获得了CaDof基因表达谱,发现在对包括两种TMV菌株,辣椒斑驳病毒和辣椒疫霉菌的生物胁迫响应过程中,CaDof家族基因表现出了时间和病原特异性变化,这表明CaDof基因的功能具有多样性.这些结果不仅为研究Dof基因在生物胁迫中的响应提供有价值的信息,同时也有助于更好地理解Dof基因在辣椒和其他物种中的多重功能.

著录项

  • 来源
    《辣椒杂志》|2018年第2期|39-50|共12页
  • 作者单位

    庆南国立大学农业与生命科学研究所农业植物科学系, 660-701, 韩国;

    首尔国立大学农业与生命科学学院植物科学系,植物基因组学与育种研究所,韩国首尔 151-921;

    首尔国立大学农业与生命科学学院植物科学系,植物基因组学与育种研究所,韩国首尔 151-921;

    首尔国立大学农业与生命科学学院植物科学系,植物基因组学与育种研究所,韩国首尔 151-921;

    庆南国立大学农业与生命科学研究所农业植物科学系, 660-701, 韩国;

    华中农业大学园艺林学学院;

    华中农业大学园艺林学学院;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类
  • 关键词

    Dof蛋白; 转录因子; 全基因组; 生物胁迫; 辣椒;

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