基于随机序列的固有无序蛋白预测算法比较分析

摘要

固有无序蛋白质(IDPs)是一种普遍存在且缺乏稳定空间结构的重要功能蛋白,为传统的蛋白质序列-结构-功能研究模式提出了挑战,成为当前蛋白质科学研究的热点领域。由于其特殊的柔性结构特征,IDPs的实验研究难度大,通过计算方法来预测IDPs成为IDPs研究的重要手段。然而由于被实验证实的IDPs还很少,对IDPs预测算法的有效评价还缺少可靠的数据集,因而通过人工设计随机蛋白序列并提出分析数理模型,从无序区残基分布、组成等多角度对两种代表性IDPs预测算法的预测结果进行了深入对比研究。结果表明各随机序列中不同IDPs预测算法得到的预测结果具有不同程度的差别,预测得到的无序区与天然蛋白中无序区序列特征一致,因此对IDPs的研究应充分考虑不同预测算法差异特征,提高研究结果的可靠性。