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COL5A2对胃癌的价值-基于荟萃分析和生物信息学分析

     

摘要

目的:探讨COL5A2在胃癌((gastric carcinoma,GC)发生中的作用.方法:采用逆转录聚合酶链反应检测正常胃上皮细胞和4株胃癌细胞中COL5A2 mRNA的表达水平,癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库和基因表达汇编(gene expression omnibus,GEO)评估COL5A2 mRNA表达,全面评估了荟萃分析的标准化均值(SMD)差异和诊断价值.应用生存分析和Cox回归分析预测COL5A2对GC患者的预后价值.使用COL5A2共表达网络和GSEA富集分析探索COL5A2的潜在功能机制.结果:COL5A2 mRNA在胃癌细胞中高表达,连续型变量荟萃分析结果表明GC中COL5A2的mRNA表达水平增加(SMD=1.31,95%CI:1.19-1.42),诊断型荟萃分析表明COL5A2对胃癌具有诊断价值(SEN=0.80;SPE=0.88;PLr=5.61;NLr=0.25;DOr=24.41).生存分析cox回归分析表明,COL5A2可作为胃癌的预后标志物.基因富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)显示,COL5A2可能通过肿瘤相关作用通路参与GC的发展.结论:COL5 A2可能是治疗GC的潜在治疗靶点和诊断、预后标志物.

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