三种罗非鱼的微卫星分子鉴定和遗传结构分析

摘要

采用77对微卫星引物对奥利(Oreochromis aureus)、尼罗(O. niloticus)和橙色莫桑比克(O.mossambicu)3种罗非鱼基因组DNA进行PCR扩增,筛选出17个微卫星鉴定位点,其中奥利亚罗非鱼的特异位点6个(UNH636、UNH117、UNH172、UNH738、UNH878和UNH896);尼罗罗非鱼的特异位点5个(UNH913、UNH907、UNH222、UNH980和UNH880)和橙色莫桑比克罗非鱼的特异位点6个(UNH876、UNH899、UNH853、UNH932、UNH933和UNH773),任意一个位点可在其中一种罗非鱼中扩增出其它两种罗非鱼不具有的条带,从而将这种罗非鱼与其它两种区分开来.利用这17个位点检测三种罗非鱼的遗传结构,共检测到142个等位基因,平均等位基因8.35个,数据经Popgen32计算和MEGA4软件作图,进行聚类分析,确立了三种罗非鱼的亲缘关系.结果奥利亚、尼罗和橙色莫桑比克三种罗非鱼的平均观测杂合度分别为0.0941、0.5490和0.2588,平均期望杂合度分别为0.1089、0.7230和0.2608,平均多态信息含量分别为0.0869、0.7149和0.1643.结果表明,尼罗罗非鱼群体的遗传多样性水平较高,奥利亚罗非鱼群体遗传多样性较低;聚类分析显示奥利亚和橙色莫桑比克罗非鱼群体的亲缘关系近.