基于RNA-seq数据发掘响应干旱的谷子C2H2型锌指蛋白基因

摘要

C2 H2型锌指蛋白在植物响应逆境胁迫以及激素信号转导过程中起着重要作用,为了发掘响应干旱胁迫的谷子C2H2型锌指蛋白基因(SiC2H2),利用转录组测序技术构建谷子聚乙二醇(PEG)处理前后转录组文库,根据表达谱数据鉴定出11个SiC2H2差异表达基因,对其进行理化性质、启动子元件等部分生物信息学分析和进化树及基因结构分析.实时荧光定量逆转录PCR(RT-PCR)验证结果表明,随机选取的4个基因在PEG胁迫前后的表达特点与表达谱数据基本一致.研究结果为后续进一步研究C2 H2型锌指蛋白在谷子抗旱性中的作用以及谷子抗旱分子育种提供了理论依据.