长鳍鲤mtDNA D-loop区序列结构和多态性分析

摘要

采用PCR技术和测序的方法分离长鳍鲤线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)的部分序列(600～602 bp),结合已报道长鳍鲤序列(387 bp),得到长鳍鲤D-loop区的全长序列(921 bp),对照其他已报道的鱼类控制区结构,成功识别长鳍鲤mtDNAD-loop区的终止序列区、中央保守区和保守序列区,找到了终止相关的序列TAS和CSB-F、CSB-E、CSB-D、CSB-1、CSB-2、CSB-3等6个特征序列,运用DNA分析软件对本研究获得的序列(600 ～ 602 bp)进行序列多态性分析.结果显示,序列碱基A+T的含量(平均为62.7％)高于G+C的含量(平均为37.3％),共检测到13个变异位点,转换为8个,颠换为3个,有2个缺失,碱基的替换有明显的偏倚.8尾个体分属6种单倍型,长鳍鲤的核苷酸多样性为0.007 32,单倍型间平均遗传距离为0.009.稀有长鳍鲤种群mtDNA D-loop区序列存在着丰富的多态性,说明该种群具有比较丰富的遗传多样性.