基于DNA条形码对岷山当归甄选与鉴别当中的应用

摘要

目的 利用DNA条形码ITS2、rbcL-a、psbA-trnH序列,对甘肃道地药材岷县当归(岷归)及其近缘属药材东当归进行鉴定分析.方法 对供试材料ITS2、rbcL-a、psbA-tmH序列进行PCR并双向测序后,用DNAMANv.4软件将得到的正向序列和反向序列进行组合,得到连续序列.利用BLAST算法对序列进行了分析.用Expasy在线软件翻译psbA和rbcL-a的序列编码,用MEGA 6软件进一步分析核苷酸序列.用MUSCLE算法对序列进行比对,最后在NCBI数据库中提供的序列对本研究中产生的psbA-trnH条码位点序列进行了系统分析.结果 ITS2、rbcL-a、psbA-trnH的序列长度分别为505、677、324bp.在rbcL-a条码位点中,对齐序列的标识率最高,为96.3％,其次是ITS2(81.78％)和psbA-trnH(67.9％)识别能力与其他两个条码位点相比建立了psbA-trnH条码位点最大的条码位点.采用邻接(Neighbour-Joining,NJ)方法,观察到岷归序列在同一簇中排列,东当归序列在不同簇中排列.DNA条码psbA-tmH可明显检测到岷归当中东当归的混杂.结论 利用ITS2、psbA-trnH DNA条形码位点标记可以检测到岷归中的东当归混杂及程度.