基于蛋白质谱技术建立胃癌诊断预测模型及其初步验证

摘要

目的基于高通量蛋白质谱技术利用ClinProTools系统筛选胃癌患者与健康对照者的血清差异蛋白/多肽,建立胃癌诊断预测模型,发现胃癌的潜在血清标志物。方法收集胃癌患者血清标本60例、对照组血清标本60例,按照3∶1随机分为训练组(胃癌患者45例,健康对照45例)和验证组(患者15例,健康对照15例)。采用弱阳离子交换磁珠(WCX-MB)吸附低丰度蛋白/多肽,通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)分析建立相应的蛋白表达指纹图谱,筛选差异表达蛋白/多肽,建立胃癌的诊断预测模型并进行验证。结果筛选出10个具有显著差异的多肽峰,差异最显著的2个多肽峰质荷比(m/z)2 952.57和m/z 5 904.36的受试者工作曲线(ROC)曲线下面积(AUC)分别为0.93和0.81。运用遗传算法(GA)建立胃癌诊断预测模型,验证组验证此模型,结果显示此模型准确性为90.00%,灵敏度为93.30%,特异度为86.70%。结论 MALDI-TOF MS联合WCX-MB能够检测到胃癌患者与健康对照者的血清差异蛋白/多肽,以此建立的胃癌蛋白质谱诊断预测模型存在着潜在的应用价值,m/z 2 952.57、5 904.36有望成为诊断胃癌的潜在血清标志物。