骨肉瘤中EMT相关基因的来源及与患者生存预后的关系分析

摘要

目的 研究骨肉瘤中上皮间质转化(EMT)相关基因的来源及与患者生存预后的关系.方法 从Gene Expression Omnibus数据库中获得3个独立的微阵列数据集(GSE36001、GSE39055和GSE16091).GSE39055和GSE16091用于探讨骨肉瘤EMT、免疫活性、基质活性和肿瘤纯度间的相关性;GSE39055的总生存率和无病生存率数据用于生存分析.通过GSE36001和该院5例骨肉瘤标本、5例基质标本验证骨肉瘤中EMT相关基因表达的关键来源.结果 GSE39055和GSE16091中,EMT评分与免疫评分、基质评分均呈正相关(P<0.05),与肿瘤纯度均呈负相关(P<0.05);肿瘤纯度与免疫评分、基质评分均呈负相关(P<0.05).GSE39055中,高EMT评分是骨肉瘤患者总生存率、无病生存率下降的危险因素(HR=4.977,P=0.003;HR=4.308,P=0.010).GSE36001中,骨肉瘤标本EMT相关基因表达水平高于基质细胞基因(P<0.05);骨肉瘤标本和基质标本之间EMT相关基因的倍数变化(FC)高于基质细胞基因(P<0.05).该院5例骨肉瘤标本中EMT相关基因表达水平高于基质细胞基因(P<0.05);5例基质标本中基质细胞基因表达水平高于EMT相关基因(P<0.05);骨肉瘤标本和基质标本之间EMT相关基因的FC高于基质细胞基因(P<0.05).结论 骨肉瘤中EMT、免疫活性、基质活性和肿瘤纯度之间存在相关性;EMT相关基因的表达与骨肉瘤患者的生存预后密切相关;基质细胞是骨肉瘤中EMT相关基因表达的关键来源.