基于Weka平台的分类算法在启动子识别中的应用

摘要

在"后基因组"时代,对于DNA功能元件的注释,尤其是启动子这类关键的调控元件的鉴定是进一步理解人类基因组繁杂调控网络的重要研究内容.本文基于高通量测序数据对细胞系H1-hesc中的基因启动子进行识别分类,利用数据挖掘软件Weka基于启动子组蛋白修饰特征建立分类模型,比较各分类算法性能优劣,以期应用最佳分类器在其它细胞系中识别分类启动子.